贝母属植物叶绿体基因组候选SNP位点应用分析

贝母属植物是中国中药材的宝库,由于形态上难以区分,在民间应用、临床应用和中药市场中还存在混淆应用、以次充好的现象,急需开发基于新型分子标记位点的精准检测方法。本研究应用多重序列比对、SNP筛选等生物信息学分析手段,对贝母属15种植物28条叶绿体基因组序列进行分析。结果发现,贝母属叶绿体基因组DNA同源性达97.22%,通过分析共发现SNP位点5879个,其中川贝母类鉴别候选位点71个,川贝母鉴别候选位点4个,瓦布贝母鉴别候选位点37个,太白贝母鉴别候选位点147个,浙贝母鉴别候选位点91个,湖北贝母鉴别候选位点271个,平贝母鉴别候选位点1393个,伊贝母鉴别候选位点89个。本研究还对SNP位点在精准鉴定、精确定量应用方面进行了讨论,可为川贝母中药资源鉴定提供技术支撑。     

农田尾菜发酵过程中农药残留变化特征

基于尾菜中存在农药残留的现状,以设施农业尾菜黄瓜秧为研究对象,采用气相色谱法和超高效液相色谱-串联质谱法检测了尾菜黄瓜秧在静态好氧发酵过程中多菌灵、吡虫啉、哒螨灵等50种农药残留的动态变化,并分析发酵重要影响因子堆高对农药残留消解的影响。结果表明:在尾菜黄瓜秧中共检测出腐霉利、多菌灵、嘧菌酯、苯醚甲环唑、烯酰吗啉、虫螨腈、吡虫啉、啶虫脒和哒螨灵9种农药残留,其中多菌灵平均残留量最高,达11.2 mg/kg,其他8种农药平均残留量在0.042~0.89 mg/kg之间。在发酵的24 d中,不同堆高条件下9种农药的消解规律均符合一级反应动力学方程,但不同农药半衰期差异较大,其中吡虫啉的平均半衰期最长,为28.9 d,多菌灵的平均半衰期最短,为10.2 d;不同堆高处理中农药的消解速率也有差异,总体上在2.5 m堆高下各农药的消解率最高、半衰期最短。本研究结果可为尾菜发酵参数优化、农业废弃物的高效资源化利用以及研发基于尾菜发酵产物的有机蔬菜专用有机肥提供理论支撑。     

绵羊Izumo1基因多态性及其与产羔数关联分析

为研究Izumo1基因多态性及与产羔数关系,本研究利用PCR和直接测序法对小尾寒羊和苏尼特羊的Izumo1基因DNA序列进行扩增、测序和BLAST分析,并和本课题组前期绵羊重测序数据进行比对,筛选出Izumo1基因SNP位点。同时,采用Sequenom MassARRAY~?技术进行基因分型,并对其SNP位点的基因型和等位基因频率在各群体中的分布进行研究。结果表明:小尾寒羊Izumo1基因DNA全长序列3 385 bp,苏尼特羊Izumo1基因DNA全长序列3 382 bp;筛选出8个Izumo1基因SNP位点,经过初步筛选,将在小尾寒羊、苏尼特羊、滩羊、萨福克羊、杜泊羊、草原藏羊这6个绵羊品种中位点分布没有差异的SNP位点排除,最终筛选获得的g.54412135AG和g.54412107CA 2个位点。Izumo1基因g.54412135AG位点在多羔和单羔绵羊品种中存在GG、GA和AA 3种基因型,G基因为优势等位基因;g.54412107CA在多羔品种中存在CC和CA 2种基因型,而在单羔品种中存在CC、CA和AA 3种基因型,C基因为优势等位基因,其基因型频率和基因频率在单、多羔绵羊群体间的分布差异均极显著(P0.01);群体遗传学分析得出g.54412135AG多态位点在6个品种中的多态信息含量(PIC)都属于低度多态(PIC0.25);g.54412107CA多态位点在杜泊羊中属于中度多态(0.25PIC0.5),在其他5个品种中都属于低度多态(PIC0.25),然而,关联分析发现Izumo1基因g.54412135AG和g.54412107CA位点的不同基因型与小尾寒羊不同胎次产羔数之间不存在显著关联(P0.05)。     

Impact of coleopteran targeting toxin (Cry3Bb1) of Bt corn on microbially mediated decomposition

Genetically engineered corn expressing crystalline proteins for insect control and encoded by genes derived from soil bacterium Bacillus thuringiensis (Bt) are widely adopted in the United States. Among the seven different events of Bt corn available commercially, YieldGard^® Rootworm (MON863) expresses a variant of the cry3Bb1 protein in the root tissue to control corn rootworm larvae. Although numerous laboratory and field studies show no unexpected ecological risks at the insect community-level above-ground, few studies have addressed the possible impact of cry proteins released from living or decaying roots of Bt corn on soil microbial communities. Here, we test the hypothesis that coleopteran-active Bt corn does not affect nontarget ecological processes, such as decomposition or the function of the associated saprophytic microbial community. Experimental treatments were: (1) a Bt hybrid; (2) a non-Bt, isogenic hybrid treated with a conventional soil insecticide; and (3) a non-Bt, isogenic hybrid without insecticide. Soil and root samples were collected at various times throughout 2 years from experimental plots to estimate microbial community function by quantifying activity of extracellular enzymes on 10 substrates. Decomposition was measured as mass loss by root decay in litter bags. Bt corn (MON863) exuding the cry3Bb1 toxin does not appear to have adverse effects on saprophytic microbial communities of soil and decaying roots or on decomposition. The addition of the soil insecticide had greater effects on microbial function in soil and decaying roots than Bt corn. Our results are similar to those found previously for the cry3Bb1 protein that showed no adverse effects on microbial community composition in controlled and natural environments. This field study is one of the first to report the use of extracellular enzyme assays to examine the effect of transgenic crops on the functional activity of microbes in soil and decaying roots.     

葡萄果实中糖类成分与品质特征研究进展

葡萄具有极高的经济价值,但其果实品质影响市场竞争力,所以一直为学界所关注.然而在制约葡萄果实品质构成的因素中,果实中糖类的组成与含量是决定果实品质的最重要因素.在综合有关文献的基础上,对葡萄果实中糖分与品质特征进行了评述,重点阐述了糖分影响葡萄鲜食品质和酿酒品质的重要作用,并提出了开展此项研究的重要意义.     

UPLC/MS/MS法测定番茄中盐酸吗啉胍残留量

采用三氯乙酸提取,HLB固相萃取柱净化,建立了番茄中盐酸吗啉胍残留量的UPLC/MS/MS测定方法。添加盐酸吗啉胍质量分数为0.005、0.05 mg.kg-1,平均回收率分别为77.7%和86.7%,相对标准偏差分别为8.1%和6.3%,定量限为0.005 mg.kg-1。     

苹果果实体积和重量测定方法的研究

本试验对苹果3个品种的果实体积和重量的测定方法进行了研究,建立了测定各品种果实体积和重量的最优多元线性回归方程及幂函数方程。另一分析结果表明:相关回归法、圆球体积法均与排水法测定果实体积的结果差异不显著,但圆球体积法的误差较大。     

猪圆环病毒病原学研究进展

猪圆环病毒(porcine circovirus,PCV)有2种不同的血清型,即猪圆环病毒1型(PCV1)和猪圆环病毒2型(PCV2)。目前研究表明PCV1暂无致病性,但PCV2则被认为是引起猪圆环疾病(PCVDs)的主要病原。很多地区养猪业的经济效益因此而遭受了重大的影响。PCV现已受到全球的关注,引起了许多专家学者的高度重视。本文对PCV的病原学最新研究进展进行了综述。     

真菌RNA沉默研究进展

阻抑(Quelling)与减数分裂沉默(Meiotic silencing by unpaired DNA,MSUD)等真菌RNA沉默(RNA silencing)现象的研究拓展了我们当前对基因表达调控的认知。随着测序信息量的爆炸性增长与功能研究的不断深入,真菌RNA沉默展示出的复杂与多样为真核生物研究提供了全新的视角。本文就当前真菌RNA沉默及相关小分子RNA(Small RNA,sRNA)的研究现状做一简要概述。